Nel villaggio sul monte Ikeno-yama, scienziati internazionali vivono e lavorano a fianco della popolazione locale e dei loro leader spirituali. Si incontrano due mondi che a prima vista sembrano estranei: il mondo della vita degli anziani residenti di un ex villaggio minerario e il mondo della ricerca di fisici internazionali che conducono ricerche scientifiche all'interno della stessa montagna. Mentre un gruppo studia la natura visibile che li circonda - montagne, alberi, animali, acqua e vento - l'altro guarda la “natura invisibile” del neutrino, cercando di scoprire se la cosiddetta particella fantasma può spiegare l'origine dell'universo.